آشفتگی های سیاسی ناشی از جنگ های داخلی و عملکرد نامطلوب حکومت مجاهدین (۷۵-۱۳۷۱ ش).علاوه بر ایجاد فساد،نا امنی ،فقر شدید فرهنگی و اقتصادی و تلفات هزاران انسان بی گناه از جمله زن و کودک،و تخریب وسیع منابع حیاتی و اقتصادی کشور؛زمینه مناسبی را برای ظهور گروه طالبان(که دارای افکار و عقائد خاصی می باشد) در صحنه سیاسی افغانستان فراهم کرد.این پژوهش سعی دارد در چهار بخش کلی به بررسی مبانی فکری،اعتقادی و دیدگاهای طالبان درباره شیعیان با رویکرد به افغانستان بپردازد. بخش اول: به بررسی چگونگی آغاز پیدایش ،عوامل ظهور و موفقیت جنبش طالبان ،ساختار و تشکیلات ،سارماندهی و رهبری،اهداف و اصول اساسی حکومت،ویژگی های امارت اسلامی،پرداخته است.و در همین بخش،به جایگاه زنان در حکومت طالبانی ،ویژگی های عمومی افراد طالبان،و دیدگاهای دیگران(جامعه بین الملل،کشورهای منطقه،ناظران و تحلیل گران) در باره جنبش طالبان و … مورد بحث قرار گرفته است. بخش دوم :به خاستگاه جنبش طالبان می پردازد که از جهاتی شبیه جنبش افراطی خوارج می ماند،و از جهاتی دیگر متاثر از جریان های بنیادگرای معاصر جهان اسلام همچون:وهابیت،دیو بندیه هند،اخوان المسلمین مصر و جریان های مذهبی و افراطی پاکستانی مانند:جمعیت علمای اسلام،سپاه صحابه و اندیشه های مودودی و … می باشد.جمع بندی و نتیجه گیری نهایی پایان بخش این پژوهش می باشد. بخش سوم :که عمده پژوهش حاضر را تشکیل می دهد،درباره دیدگاه های طالبان درباره شیعیان می پردازد.که شامل مباحث:تعامل طالبان با شیعیان در مقایسه با اهل سنت،راه های بدست آوردن حکومت ،مبانی فقهی و اندیشه کلامی طالبان ،تاریخچه تکفیر طالبان نسبت به شیعیان،عبدالرحمان و تکفیر شیعیان،لزوم پرداخت جزیه و فلسفه آن ،خشونت و کار نامه سیاه طالبان ،اعلامیه چهار ماده طالبان با مبانی اسلامی،مفهوم ارزش ها در نظام طالبانی ؛قتل عام شیعیان،ایرانی خواندن شیعه،تاریخ ورود اسلام و تشیع در افغانستان ،علل دشمنی طالبان با شیعیان،مظلومیت شیعیان ،رهبر شهید و طالبان ،و خلاصه از زندگی و سخنان رهبر شهید و … می باشد. بخش چهارم:خود در دو بخش کلی ،جمع بندی که خلاصه مباحث در آن آورده شده است.و نتیجه گیری نهایی از کل این مجموعه،که در واقع آنچه را که غرض و اهداف از این پژوهش بوده است را بیان کرده است.